НПП "Подольские Толтры" размещен на территории трех административных районов Хмельницкой области: Каменец-Подольского, Чемеровецкого и Городокского, что составляет 261316 га (12,5% территории Хмельницкой обл.).Географические координаты территории НПП "Подольские Толтры":
Южная граница - по реке Днестр (от 26°30'с.ш. 48°20'з.д. до 27°30'с.ш. 48°20'з.д.),
Западная граница - по реке Збруч (от 26°30'с.ш. 48°20'з.д. до 26°30'с.ш. 49°20'з.д.),
Северная граница (от 26°00'с.ш. 49°20'з.д. до 27°30'с.ш. 49°20'з.д.),
Восточная граница - по реке Ушица (від 27°30'с.ш. 48°20'з.д. до 27°30'с.ш. 49°20'з.д.).
